毒株信息
编号： OEAV000478 发布时间： 2020-03-07 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/CA-CDPH-UC3/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/CA-CDPH-UC3/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29851
有效碱基数量：
29847
有效碱基百分比：
99.99%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
Health care worker
分离来源：
-
测序技术：
Illumina NextSeq (+MSSPE enrichment)
组装方法：
Geneious 11.1.3
覆盖度：
120X
相关链接：
EPI_ISL_413559
提交者：
Xianding Deng, Scot Federman, Chao-Yang Pan, Hugo Guevara,Wei Gu, Debra A. Wadford, and Charles Y. Chiu
提交者单位：
Chiu Laboratory, University of California, San Francisco
提交者地址：
600 16th Street, UCSF Genentech Hall, Room S316, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158
样本信息
编号： OESV000478 采样时间： 2020-02-27
采样地点：
North America / USA / California / Solano County
地点补充信息：
-
采样单位：
California Department of Public Health
采样地址：
California Department of Public Health, Viral and Rickettsial Disease Laboratory, 850 Marina Bay Pkwy, Richmond, CA 94804