系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV013420
发布时间:
2020-01-29
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Bat coronavirus RaTG13
毒株别名:
-
病毒说明:
Bat coronavirus RaTG13, complete genome
物种名称:
Bat coronavirus RaTG13
物种ID:
2709072
属名:
-
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, unclassified Coronaviridae, Bat coronavirus RaTG13]
序列长度:
29855
有效碱基数量:
29855
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Rhinolophus affinis
宿主补充信息:
-
分离来源:
feces
测序技术:
Illumina
组装方法:
CLC Genomics Workbench v. 12.0
覆盖度:
-
相关链接:
MN996532
提交者:
Zhu,Y., Yu,P., Li,B., Hu,B., Si,H.R., Yang,X.L., Zhou,P. and Shi,Z.L.
提交者单位:
CAS Key Laboratory of Special Pathogens, Wuhan Institute of Virology, Center for Biosafety Mega-Science, Chinese Academy of Sciences
提交者地址:
No. 44 Xiao Hong Shan, Wuhan, Hubei 430071, China
样本信息
编号:
OESV013420
采样时间:
2013-07-24
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020