系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV013432
发布时间:
2019-09-01
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Bat coronavirus strain BtCoV92
毒株别名:
-
病毒说明:
Bat coronavirus strain BtCoV92, complete genome
物种名称:
Bat coronavirus
物种ID:
1508220
属名:
-
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Coronavirinae, unclassified Coronavirinae, Bat coronavirus]
序列长度:
29585
有效碱基数量:
29583
有效碱基百分比:
99.99%
宿主:
Cynopterus brachyotis
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Illumina
组装方法:
Geneious v. R11
覆盖度:
-
相关链接:
MK492263
提交者:
Lim,X.F., Lee,C.B., Pascoe,S.M., How,C.B., Chan,S., Tan,J.H., Yang,X., Zhou,P., Shi,Z., Sessions,O.M., Wang,L.-F., Ng,L.C., Anderson,D.E. and Yap,G.
提交者单位:
Emerging Infectious Diseases, Duke-NUS Medical School
提交者地址:
8 College Rd, Singapore 169857, Singapore
样本信息
编号:
OESV013432
采样时间:
2015-01-01
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020