系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV013469
发布时间:
2019-10-19
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Bat paramyxovirus strain Bat-PV-16723
毒株别名:
-
病毒说明:
Bat paramyxovirus strain Bat-PV-16723, complete genome
物种名称:
Bat paramyxovirus
物种ID:
1300978
属名:
-
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Negarnaviricota, Haploviricotina, Monjiviricetes, Mononegavirales, Paramyxoviridae, unclassified Paramyxoviridae, Bat paramyxovirus]
序列长度:
18485
有效碱基数量:
18485
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Miniopterus griveaudi
宿主补充信息:
-
分离来源:
spleen, abdominal cavity
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
MG203876
提交者:
Pascalis,H., Melade,J., Piorkowski,G., Turpin,M., Temmam,S., Ghawar,W., Goodman,S.M., Mavingui,P., de Lamballerie,X.N. and Dellagi,K.
提交者单位:
UMR PIMIT, Universite de La Reunion
提交者地址:
Plateforme de recherche CYROI - 2, rue Maxime Riviere, Ste Clotilde, La Reunion 97490, France
样本信息
编号:
OESV013469
采样时间:
2011-01-01
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020