系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV014796
发布时间:
2018-08-24
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Betacoronavirus England 1
毒株别名:
-
病毒说明:
Betacoronavirus England 1, complete genome
物种名称:
Betacoronavirus England 1
物种ID:
1263720
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Merbecovirus, Middle East respiratory syndrome-related coronavirus, Betacoronavirus England 1]
序列长度:
30111
有效碱基数量:
30111
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
NC_038294
提交者:
Galiano,M., Myers,R., Bermingham,A., Gopal,R. and Zambon,M.
提交者单位:
Microbiological Services, Health Protection Agency
提交者地址:
61 Colindale Avenue, London NW9 5EQ, United Kingdom
样本信息
编号:
OESV014796
采样时间:
2012-09-11
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020