系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV039531
发布时间:
2019-12-04
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
European bat lyssavirus isolate 22540
毒株别名:
-
病毒说明:
European bat lyssavirus isolate 22540, complete genome
物种名称:
European bat lyssavirus
物种ID:
38768
属名:
Lyssavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Negarnaviricota, Haploviricotina, Monjiviricetes, Mononegavirales, Rhabdoviridae, Lyssavirus, unclassified Lyssavirus, European bat lyssavirus]
序列长度:
11935
有效碱基数量:
11935
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Eptesicus serotinus
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
IonTorrent
组装方法:
Geneious v. 9.1.8
覆盖度:
-
相关链接:
MK251242
提交者:
Banyai,K. and Forro,B.
提交者单位:
New Pathogen Discovery, Institute for Veterinary Medical Research
提交者地址:
Hungaria krt. 21., Budapest H-1143, Hungary
样本信息
编号:
OESV039531
采样时间:
2011-01-01
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020