系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV040387
发布时间:
2016-06-10
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Ferret coronavirus isolate FRCoV-NL-2010
毒株别名:
-
病毒说明:
Ferret coronavirus isolate FRCoV-NL-2010, complete genome
物种名称:
Ferret coronavirus
物种ID:
1264898
属名:
Alphacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Alphacoronavirus, Minacovirus, Ferret coronavirus]
序列长度:
28434
有效碱基数量:
28434
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Mustela putorius
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Sanger dideoxy sequencing; 454
组装方法:
CLC BIO v. 5.5
覆盖度:
-
相关链接:
NC_030292
提交者:
Stalin Raj,V., Provacia,L.B.V., Smits,S.L., Osterhaus,A.D.M.E. and Haagmans,B.L.
提交者单位:
Department of Viroscience, Erasmus Medical Center
提交者地址:
dr Molewaterplein 50, Rotterdam 3015 GE, The Netherlands
样本信息
编号:
OESV040387
采样时间:
2010-01-01
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020