毒株信息
编号： OEAV1075542 发布时间： 2021-03-21 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Togo/BMC-394-20/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Togo/BMC-394-20/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29857
有效碱基数量：
29856
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oropharyngeal swab
测序技术：
Illumina MiSeq
组装方法：
SeqManNextgen
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_1303031
提交者：
Mounerou SALOU, Christelle BUTEL, Wembo A. HALATOKO,Issaka Maman, Abla A. KONOU, Amivi EHLAN, Adodo SADJI, Kokou TEGUENI,Sidonie A.M.KAGNISSODE, Akoélé SILIADIN, Alassane OURO-MEDELI, Messanh DOUFFAN,Déléma MABA,Sika DOSSIM, Améyo DORKENOO, Mireille PRINCE-DAVID,Anoumou DAGNRA,Laetitia SERRANO,Ahidjo AYOUBA,Eric DELAPORTE, Martine PEETERS
提交者单位：
Unité Mixte Internationale TransVIHMI (UMI 233 IRD – U1175 INSERM - Université de Montpellier)IRD (Institut de recherche pour le développement)
提交者地址：
911, avenue Agropolis - BP 64501 34394 Montpellier Cedex 5
样本信息
编号： OESV1075542 采样时间： 2020-03-29
采样地点：
Africa / Togo / Lome / Golfe
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
28
采样单位：
Institut National d’Hygiène (INH)
采样地址：
26, Rue Nangbéto Quartier Administratif - B.P 1396 Tel: (+228) 22 21 06 33 www.inhtogo.tg Lomé - Togo