毒株信息
编号： OEAV1075949 发布时间： 2021-03-16 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/CA-CDC-STM-000014150/2021
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/CA-CDC-STM-000014150/2021
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29889
有效碱基百分比：
99.95%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Nasal swab
测序技术：
Illumina
组装方法：
COVIDSEQ
覆盖度：
>50x
相关链接：
EPI_ISL_1262278
提交者：
Peter W. Cook, Dakota Howard, Dhwani Batra, Ben L. Rambo-Martin, Eileen de Feo, Jan Antico, Christine Tran, Matthew Tolentino, Shannon Wickline, Kim Gietzen, Brad Sickler, Jingtao Liu, Eric Allen, Phil Febbo, Summer Galloway, Nicole L. Washington, Simon White, Geraint Levan, Kelly Schiabor Barrett, Elizabeth Cirulli, Alexandre Bolze, Ary Ascencio, Charlotte Rivera-Garcia, Ryan Cho, Jason Nguyen, Sherry Wang, Jimmy Ramirez, Tyler Cassens, Efren Sandoval, Magnus Isaksson, William Lee, David Becker, Marc Laurent, James Lu, Clinton R. Paden, Suxiang Tong, Duncan MacCannell
提交者单位：
Centers for Disease Control and Prevention Division of Viral Diseases, Pathogen Discovery
提交者地址：
1600 Clifton Road, N.E. 30333 Atlanta United States
样本信息
编号： OESV1075949 采样时间： 2021-02-14
采样地点：
North America / USA / California
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
48
采样单位：
Helix/Illumina
采样地址：
9875 Towne Centre Dr, San Diego, CA 92121