系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV109028
发布时间:
2001-04-23
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Porcine epidemic diarrhea virus
毒株别名:
-
病毒说明:
Porcine epidemic diarrhea virus, complete genome
物种名称:
Porcine epidemic diarrhea virus
物种ID:
28295
属名:
Alphacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Alphacoronavirus, Pedacovirus, Porcine epidemic diarrhea virus]
序列长度:
28033
有效碱基数量:
28033
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
-
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
NC_003436
提交者:
Kocherhans,R., Bridgen,A., Ackermann,M. and Tobler,K.
提交者单位:
Virologisches Institut, Vet. Med. Fak., University of Zurich
提交者地址:
Winterthurerstrasse 266a, Zurich CH-8057, Switzerland
样本信息
编号:
OESV109028
采样时间:
-
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
->
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
virus id
virus name
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country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020