系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV113982
发布时间:
2012-07-10
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Rabbit coronavirus HKU14
毒株别名:
-
病毒说明:
Rabbit coronavirus HKU14, complete genome
物种名称:
Rabbit coronavirus HKU14
物种ID:
1160968
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, unclassified Betacoronavirus, Rabbit coronavirus HKU14]
序列长度:
31100
有效碱基数量:
31100
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Oryctolagus cuniculus
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
NC_017083
提交者:
Lau,S.K.P., Woo,P.C.Y., Yip,C.C.Y., Fan,R.Y.Y., Wang,M., Huang,Y., Guo,R.T., Lam,C.S.F., Lai,K.K.Y., Chan,K.H., Che,X.Y., Zheng,B.J. and Yuen,K.Y.
提交者单位:
Microbiology, The University of Hong Kong
提交者地址:
University Pathology Building, Queen Mary Hospital, Hong Kong
样本信息
编号:
OESV113982
采样时间:
2006-01-01
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020