系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV115401
发布时间:
2009-07-13
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Rat coronavirus Parker
毒株别名:
-
病毒说明:
Rat coronavirus Parker, complete genome
物种名称:
Rat coronavirus Parker
物种ID:
502102
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Embecovirus, Murine coronavirus, Rat coronavirus, Rat coronavirus Parker]
序列长度:
31250
有效碱基数量:
31250
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Rattus
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
NC_012936
提交者:
Spiro,D., Halpin,R., Wang,S., Hostetler,J., Overton,L., Tsitrin,T., Katzel,D., Sarmiento,M., Sitz,J., Amedeo,P., Caler,E., Lorenzi,H., Schobel,S., Sundaram,J. and Weiss,S.
提交者单位:
J. Craig Venter Institute
提交者地址:
9704 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850, USA
样本信息
编号:
OESV115401
采样时间:
-
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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毒株也检测到该变异
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020