毒株信息
编号： OEAV120960 发布时间： 2020-02-12 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate 2019-nCoV/USA-CA6/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate 2019-nCoV/USA-CA6/2020, complete genome
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度：
29858
有效碱基数量：
29858
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
oronasopharynx
测序技术：
Nanopore; Sanger dideoxy sequencing
组装方法：
Sequencher v. 5.4.6; minimap v. 2.17
覆盖度：
100X
相关链接：
MT044258
提交者：
Zhang,J., Queen,K., Li,Y., Tao,Y., Uehara,A., Paden,C.R., Lu,X., Lynch,B., Sakthivel,S.K.K., Whitaker,B.L., Kamili,S., Wang,L., Murray,J.R., Gerber,S.I., Lindstrom,S. and Tong,S.
提交者单位：
Division of Viral Diseases, Centers for Disease Control and Prevention
提交者地址：
1600 Clifton Rd NE, Atlanta, GA 30033, USA
样本信息
编号： OESV120960 采样时间： 2020-01-27
病毒注释