系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV131961
发布时间:
2008-06-03
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Turkey coronavirus
毒株别名:
-
病毒说明:
Turkey coronavirus, complete genome
物种名称:
Turkey coronavirus
物种ID:
11152
属名:
Gammacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Gammacoronavirus, Igacovirus, Avian coronavirus, Turkey coronavirus]
序列长度:
27657
有效碱基数量:
27656
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Meleagris gallopavo
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
NC_010800
提交者:
Gomaa,M., Barta,J.R., Ojkic,D. and Yoo,D.
提交者单位:
Pathobiology, University of Guelph
提交者地址:
Guelph, ON N1G2W1, Canada
样本信息
编号:
OESV131961
采样时间:
-
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
virus id
virus name
host
country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020