系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV132344
发布时间:
2019-05-21
基因组完整性:
complete
病毒类型
DNA viruses
毒株名称:
UNVERIFIED: Bat Gemycircularvirus isolate DXHL6
毒株别名:
-
病毒说明:
UNVERIFIED: Bat Gemycircularvirus isolate DXHL6, complete genome
物种名称:
Bat gemycircularvirus
物种ID:
2576222
属名:
Gemycircularvirus
分类谱系:
[root, Viruses, Genomoviridae, Gemycircularvirus, unclassified Gemycircularvirus, Bat gemycircularvirus]
序列长度:
2154
有效碱基数量:
2154
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Hipposideros larvatus
宿主补充信息:
-
分离来源:
feces, abdominal cavity
测序技术:
Sanger dideoxy sequencing
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
MK050014
提交者:
Yan,C., Dong,X., He,B. and Tu,C.
提交者单位:
Virology, Military Veterinary Institute
提交者地址:
Rd. Liuying West 666, Changchun, Jilin 130122, China
样本信息
编号:
OESV132344
采样时间:
2016-01-01
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020