系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV13598855
发布时间:
2022-03-18
基因组完整性:
-
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/France/ARA-MIDxMGI0x100/2022
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/France/ARA-MIDxMGI0x100/2022
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29685
有效碱基数量:
29664
有效碱基百分比:
99.93%
宿主:
Laboratory derived
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
EPI_ISL_11171164
提交者:
Antonin Bal, Bruno Simon, Theophile Boyer, Gregory Destras, Gwendolyne Burfin, Hadrien Regue, Quentin Semanas, Martine Valette, Bruno Lina, Laurence Josset
提交者单位:
CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
样本信息
编号:
OESV13598855
采样时间:
2022-02-11
采样地点:
Europe / France / Auvergne-Rhone-Alpes / Lyon
地点补充信息:
-
采样单位:
CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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virus id
virus name
host
country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020