毒株信息
编号： OEAV142371 发布时间： 2020-03-11 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Brazil/RJ-FIOCRUZ-314/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Brazil/RJ-FIOCRUZ-314/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29768
有效碱基数量：
29767
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Nasopharyngeal swab
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
-
覆盖度：
6,000x (average)
相关链接：
EPI_ISL_414045
提交者：
Paola Resende, Alisson Fabri, Joilson Xavier, Sunando Roy, Fernando Motta, Aline Mattos, Milene Miranda, Cristiana Garcia, Braulia Caetano, Maria Ogrzewalska, Jonathan Lopes, Luciana Appolinario, Maria Nóbrega, Marilda SiqueiraFiocruz COVID-19 Genomic Surveillance Network
提交者单位：
Laboratory of Respiratory Viruses and Measles, Oswaldo Cruz Institute, FIOCRUZ
提交者地址：
Av. Brasil, Manguinhos, 21040-360 Rio de Janeiro, Brazil
样本信息
编号： OESV142371 采样时间： 2020-03-04
采样地点：
South America / Brazil / Rio de Janeiro
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
52
采样单位：
Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels (LACEN-RJ)
采样地址：
R. do Rezende, 118 - Centro, Rio de Janeiro - RJ, 20231-092, Brazil