毒株信息
编号： OEAV142376 发布时间： 2020-03-15 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/DRC/KN-13/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/DRC/KN-13/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29621
有效碱基数量：
28854
有效碱基百分比：
97.41%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oro-pharyngeal swab
测序技术：
Illumina Miseq
组装方法：
iVar pipeline
覆盖度：
minimum 50x
相关链接：
EPI_ISL_414647
提交者：
Placide Mbala-Kingebeni, Edith Nkwembe, Eddy Kinganda-Lusamaki, Amuri Aziza, Catherine Pratt, Matthias Pauthner, Josh Quick, Allison Black, James Hadfield, Trevor Bedford, Ian Goodfellow, Nick Loman, Kristian Andersen, Michael Wiley, Steve Ahuka-Mundeke, Jean-Jacques Muyembe Tamfum
提交者单位：
Pathogen Sequencing Lab, National Institute for Biomedical Research (INRB)
提交者地址：
Institut National de Recherche Biomédicale (INRB)Avenue de la Démocratie ( ex-Huileries)BP 1197 Kinshasa/GombeRépublique démocratique du Congo
样本信息
编号： OESV142376 采样时间： 2020-03-09
采样地点：
Africa / Democratic Republic of the Congo / Kinshasa
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
52
采样单位：
Viral Respiratory Lab, National Institute for Biomedical Research (INRB)
采样地址：
Institut National de Recherche Biomédicale (INRB)Avenue de la Démocratie ( ex-Huileries)BP 1197 Kinshasa/GombeRépublique démocratique du Congo