毒株信息
编号： OEAV142377 发布时间： 2020-03-12 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/CzechRepublic/951/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/CzechRepublic/951/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29622
有效碱基数量：
29601
有效碱基百分比：
99.93%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
probably infected during a holiday in Italy; mild respiratory signs
分离来源：
Oro-pharyngeal swab
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
Canu/Nanopolish draft assembly
覆盖度：
107,4x SD +/- 71
相关链接：
EPI_ISL_414477
提交者：
Alexander Nagy, Oldrich Bartos, Helena Jirincova, Klara Labska, Ludmila Novakova, Olga Storkanova, Dusan Trnka, Jaromira Vecerova
提交者单位：
State Veterinary Institute Prague
提交者地址：
Sidlistni, 136/24, 165 03, Prague 6, Czech Republic
样本信息
编号： OESV142377 采样时间： 2020-03-01
采样地点：
Europe / Czech Republic / Usti nad Labem
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
44
采样单位：
The National Institute of Public Health Center for Epidemiology and Microbiology
采样地址：
Šrobárova 49/48, 100 00, Prague 10, Czech Republic