毒株信息
编号： OEAV142398 发布时间： 2020-03-15 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/France/HDF-1805/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/France/HDF-1805/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29899
有效碱基数量：
29733
有效碱基百分比：
99.44%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Ora-pharyngeal swab
测序技术：
Illumina NextSeq 500
组装方法：
CLC Genomics Workbench 20
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_414628
提交者：
Mélnie Albert, Marion Barbet, Sylvie Behillil, Méline Bizard, Angela Brisebarre, Flora Donati Vincent Enouf, Maud Vanpeene, Sylvie van der Werf, Raulin Olivia
提交者单位：
National Reference Center for Viruses of Respiratory Infections, Institut Pasteur, Paris
提交者地址：
28, rue du Docteur Roux75015 ParisFrance
样本信息
编号： OESV142398 采样时间： 2020-03-02
采样地点：
Europe / France / Hauts-de-France / Compiègne
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
82
采样单位：
Centre Hospitalier Compiègne Laboratoire de Biologie
采样地址：
8 av Henri Adnot60200 Compiègne