毒株信息
编号： OEAV142488 发布时间： 2020-03-12 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Spain/VC-FISABIO-2/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Spain/VC-FISABIO-2/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29611
有效碱基数量：
28191
有效碱基百分比：
95.20%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Naso-pharyngeal aspirate
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
ARCTIC pipeline
覆盖度：
275x
相关链接：
EPI_ISL_414496
提交者：
David Navarro, María Alma Bracho, Giuseppe D'Auria, Griselda De Marco, Neris Garcia-Gonzalez, Fernando Gonzalez-Candelas
提交者单位：
Sequencing and Bioinformatics Service. Molecular Epidemiology Laboratory. FISABIO-Public Health
提交者地址：
Avda. Catalunya, 21. Valencia E-46020.
样本信息
编号： OESV142488 采样时间： 2020-03-04
采样地点：
Europe / Spain / Comunitat Valenciana / Valencia
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
27
采样单位：
Servicio Microbiologia. Hospital Clinico Universitario. Valencia.
采样地址：
Avda. Blasco Ibañez, 15. Valencia E-46010. Spain.