毒株信息
编号： OEAV142489 发布时间： 2020-03-14 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Spain/VC-FISABIO-3/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Spain/VC-FISABIO-3/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29782
有效碱基数量：
29781
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
ARCTIC pipeline
覆盖度：
215x
相关链接：
EPI_ISL_414598
提交者：
David Navarro, Maria Alma Bracho, Giuseppe D'Auria, Griselda De Marco, Neris Garcia-Gonzalez, Fernando Gonzalez-Candelas
提交者单位：
Sequencing and Bioinformatics Service and Molecular Epidemiology Research Group. FISABIO-Public Health.
提交者地址：
Avda. Catalunya 21. Valencia E-46020. Spain.
样本信息
编号： OESV142489 采样时间： 2020-03-05
采样地点：
Europe / Spain / Comunitat Valenciana / Valencia
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
89
采样单位：
Servicio Microbiologia, Hospital Clinico Universitario, Valencia
采样地址：
Avda. Blasco Ibañez, 15. E-46010 Valencia, Spain