毒株信息
编号： OEAV142495 发布时间： 2020-03-12 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/Cruise-CDC-03052610-001/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/Cruise-CDC-03052610-001/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29882
有效碱基数量：
29876
有效碱基百分比：
99.98%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oropharyngeal swab
测序技术：
Nanopore MinION, Illumina MiSeq, Sanger
组装方法：
minimap 2.17, bwa 0.7.17, Sequencher 5.4.6.
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_414483
提交者：
Krista Queen, Anna Uehara, Ying Tao, Clinton R. Paden, Jing Zhang, Yan Li, Haibin Wang, Shifaq Kamili, Xiaoyan Lu, Brian Lynch, Senthil Kumar K. Sakthivel, Brett L. Whitaker, Lijuan Wang, Janna' R. Murray, Jasmine Padilla, Justin Lee, Susan I. Gerber, Stephen Lindstrom, Suxiang Tong
提交者单位：
Pathogen Discovery, Respiratory Viruses Branch, Division of Viral Diseases, Centers for Disease Control and Prevention
提交者地址：
1600 Clifton Rd NE, Atlanta GA 30329
样本信息
编号： OESV142495 采样时间： 2020-02-17
采样地点：
North America / USA
地点补充信息：
-
采样单位：
unknown