毒株信息
编号： OEAV142501 发布时间： 2020-03-12 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/NY1-PV08001/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/NY1-PV08001/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29760
有效碱基数量：
29759
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
PacBio
组装方法：
-
覆盖度：
20,000x
相关链接：
EPI_ISL_414476
提交者：
Gopi Patel, Emilia Sordillo, Melissa Gitman, Alberto Paniz-mondolfi, Matthew Hernandez, Shelcie Fabre, Jose Polanco, Ana Sylvia Gonzalez-Reiche, Zenab Khan, Nancy Francoeur, Melissa Smith, Robert Sebra, Lisa Miorin, Wen-chun Liu, Randy Albrecht, Judith Aberg, Florian Krammer, Adolfo Garcia-Sarstre, Viviana Simon, Harm van Bakel
提交者单位：
MSHS Pathogen Surveillance Program
提交者地址：
1470 Madison Av., New York, NY 10029
样本信息
编号： OESV142501 采样时间： 2020-02-29
采样地点：
North America / USA / New York
地点补充信息：
History of travel to Iran
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
39
采样单位：
MSHS Clinical Microbiology Laboratories
采样地址：
Madison Avenue, New York, NY 10029