毒株信息
编号： OEAV1449543 发布时间： 2021-04-08 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/PA-VSP9962/2021
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/PA-VSP9962/2021
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29882
有效碱基数量：
29882
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Canine
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Illumina NextSeq
组装方法：
Samtools v. 1.10; BCFtools v. 1.10.2
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_1511582
提交者：
John Everett, Kyle Rodino, Shantan Reddy, Pascha Hokama, Aoife M. Roche, Young Hwang, Abigail Glascock, Scott Sherrill-Mix, Samantha A. Whiteside, Jevon Graham-Wooten, Layla A. Khatib, Ayannah S. Fitzgerald, Arupa Ganguly, Mike Feldman, Brendan Kelly, Ronald G. Collman and Frederic Bushman
提交者单位：
Bushman Lab - University of Pennsylvania
提交者地址：
425 Johnson Pavilion 3610 Hamilton Walk Philadelphia, PA 19104
样本信息
编号： OESV1449543 采样时间： 2021-03-01
采样地点：
North America / USA / Pennsylvania / SE Pennsylvania
地点补充信息：
-
采样单位：
Hospital of the University of Pennsylvania Molecular Pathology Lab
采样地址：
3400 Spruce St. Philadelphia, PA 19104