毒株信息
编号： OEAV152079 发布时间： 2020-04-18 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Russia/StPetersburg-RII4332S/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Russia/StPetersburg-RII4332S/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29903
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Nasopharyngeal swab
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
Minimap2 + Ugene v33
覆盖度：
50x
相关链接：
EPI_ISL_427339
提交者：
Andrey Komissarov, Artem Fadeev, Mariia Sergeeva, Anna Ivanova, Daria Danilenko
提交者单位：
WHO National Influenza Centre Russian Federation
提交者地址：
Prof Popova Str. 15/17, Saint Petersburg, Russian Federation, 197376
样本信息
编号： OESV152079 采样时间： 2020-03-25
采样地点：
Europe / Russia / Saint Petersburg
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
-
宿主年龄：
56
采样单位：
WHO National Influenza Centre Russian Federation
采样地址：
Prof Popova Str. 15/17, Saint Petersburg, Russian Federation, 197376