毒株信息
编号: OEAV152524 发布时间: 2020-04-18 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/USA/WI-UW-134/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/USA/WI-UW-134/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29782
有效碱基数量:
29782
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
Nasal swab
测序技术:
Nanopore GridION -- ARTIC protocol
组装方法:
custom -- minimap2
覆盖度:
400x
相关链接:
提交者:
Gage Moreno, Katarina Braun, et al. AIDS Vaccine Research Laboratories
提交者单位:
University of Wisconsin-Madison AIDS Vaccine Research Laboratories
提交者地址:
555 Science Drive Madison WI 53711
样本信息
编号: OESV152524 采样时间: 2020-04-13
采样地点:
North America / USA / Wisconsin
地点补充信息:
-
采样单位:
University of Wisconsin-Madison AIDS Vaccine Research Laboratories
采样地址:
555 Science Drive Madison WI 53711