毒株信息
编号： OEAV156033 发布时间： 2020-04-23 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Sweden/20-08169/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Sweden/20-08169/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29903
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Ion Torrent S5 XL, Ion AmpliSeq SARS-CoV-2
组装方法：
Consensus extraction from NC_045512 using torrent suite variantCaller with fill from reference and majority wins
覆盖度：
20x
相关链接：
EPI_ISL_429123
提交者：
Arne Kotz, Olov Svartstrom, Maria Lind Karlberg, Anna-Malin Linde, Oskar Karlsson Lindsjo, Anna Risberg, Shaman Muradrasoli, Karin Tegmark-Wisell
提交者单位：
The Public Health Agency of Sweden
提交者地址：
Nobels vag 18, Solna, Sweden
样本信息
编号： OESV156033 采样时间： 2020-03-12
采样地点：
Europe / Sweden / Halland
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
56
采样单位：
Klinisk mikrobiologi och vardhygien Halmstad
采样地址：
Hallands sjukhus mikrobiologi och vardhygien 30185 Halmstad