毒株信息
编号： OEAV156857 发布时间： 2020-04-26 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/NY-NYUMC385/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/NY-NYUMC385/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29903
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Ribo-depleted, Illumina Novaseq
组装方法：
bwa/0.7.17, mapped to NC_045512v2, bases below 20x coverage masked
覆盖度：
27511x
相关链接：
EPI_ISL_430412
提交者：
Maria Aguero-Rosenfeld, Brendan Belovarac, Margaret Black, Ludovic Boytard, John Cadley, Paolo Cotzia, John Chen, Dacia Dimartino, Xiaojun Feng, Tatyana Gindin, Emily Guzman, Adriana Heguy, Megan Hogan, Emily Huang, George Jour, Lawrence H. Lin, Raven Luther, Andrew Lytle, Christian Marier, Matthew T. Maurano, Mark J. Mulligan, Peter Meyn, Raquel Ordonez Ciriza, Iman Osman, Jared Pinnell, Vanessa Raabe, Sitharam Ramaswami, Amy Rapkiewicz, Andre M. Ribeiro-dos-Santos, Marie Samanovic-Golden, Antonio Serrano, Guomiao Shen, Matija Snuderl, Theodore Vougiouklakis, Nick Vulpescu, Gael Westby, Paul Zappile, Yutong Zhang
提交者单位：
Departments of Pathology and Medicine, New York University School of Medicine
提交者地址：
New York, NY 10016
样本信息
编号： OESV156857 采样时间： 2020-04-10
采样地点：
North America / USA / New York / Staten Island
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
46
采样单位：
NYU Langone Health
采样地址：
150 55th St, Brooklyn, NY 11220