毒株信息
编号： OEAV158913 发布时间： 2020-04-06 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/tiger/USA/NY-040420/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/tiger/USA/NY-040420/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29897
有效碱基数量：
29897
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Panthera tigris jacksoni
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oral swab; Nasal swab; Tracheal wash
测序技术：
Illumina MiSeq
组装方法：
iVar 1.1
覆盖度：
10,000x
相关链接：
EPI_ISL_420293
提交者：
Patrick K. Mitchell, Renee R. Anderson, Brittany Chilson, Roopa Venugopalan, D. G. Diel, Laura B. Goodman, L. Wang, F. Yuan, Y. Fang, Mary Lea Killian, Kerrie Franzen, Nichole Hines Bergeson, Ivan Kuzmin, Melinda Jenkins-Moore, Tod P. Stuber
提交者单位：
Diagnostic Virology Laboratory, United States Department of Agriculture, National Veterinary Services Laboratories
提交者地址：
1920 Dayton Avenue, Ames, IA 50010, USA 240 Farrier Road, Ithaca, NY 14850, USA 2001 South Lincoln Avenue, Urbana, Illinois 61802, USA
样本信息
编号： OESV158913 采样时间： 2020-04-02
采样地点：
North America / USA / New York
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
4
采样单位：
Wildlife Conservation Society, Bronx Zoo
采样地址：
2300 Southern Boulevard, Bronx, New York 10460