毒株信息
编号: OEAV159019 发布时间: 2020-05-08 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/Latvia/011/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/Latvia/011/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29903
有效碱基数量:
29903
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
Nasopharyngeal and Oropharyngeal swab
测序技术:
DNBSEQ-G400RS, MGI Tech Co., Ltd
组装方法:
bowtie2
覆盖度:
37x
相关链接:
提交者:
Ivars Silamiķelis, Kaspars Megnis, Monta Ustinova, Ņikita Zrelovs, Vita Rovīte, Jeļena Storoženko, Tatjana Kolupajeva, Oksana Savicka, Uga Dumpis, Jānis Kloviņš
提交者单位:
Latvian Biomedical Research and Study Centre
提交者地址:
Ratsupites 1, Riga, LV-1067, Latvia
样本信息
编号: OESV159019 采样时间: 2020-03-24
采样地点:
Europe / Latvia
地点补充信息:
-
采样单位:
Latvijas Infektoloģijas centrs
采样地址:
Linezera iela 3, Rīga, LV-1006