毒株信息
编号： OEAV177574 发布时间： 2020-06-01 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/LA-EVTL154/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/LA-EVTL154/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29840
有效碱基数量：
29840
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Nasopharyngeal swab
测序技术：
Illumina NextSeq
组装方法：
breseq v0.34.1; genome diff, mapping to EPI_ISL_40212
覆盖度：
11,158x
相关链接：
EPI_ISL_455997
提交者：
John A. Vanchiere, Jeremy P. Kamil, Rona S. Scott, Camille F. Abshire, Abida Siddiqa, Byeong-Jae Lee, Chan-ki Min, Md Maksudul Alam, Monica Gestal-Cartele, Edna Ondari, Adam Greer, Malgorzata Bienkowska-Haba, Katarzyna Zwolinska, Michelle M. Arnold, Jason M. Bodily, Andrew D. Yurochko, Paul M. Weinberger, Christopher G. Kevil, Martin J. Sapp, Daniel J. Snyder, Vaughn S. Cooper
提交者单位：
Microbial Genome Sequencing Center
提交者地址：
355 Fifth Avenue, Suite 810, Pittsburgh, PA 15222 USA
样本信息
编号： OESV177574 采样时间： 2020-04-01
采样地点：
North America / USA / Louisiana / Caddo Parish
地点补充信息：
Caddo Parish
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
76
采样单位：
LSUHS Emerging Viral Threat Laboratory
采样地址：
1501 Kings Hwy, Shreveport, LA 71103 USA