毒株信息
编号: OEAV1856402 发布时间: 2021-05-08 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/Egypt/ARMY-404/2021
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/Egypt/ARMY-404/2021
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29783
有效碱基数量:
29762
有效碱基百分比:
99.93%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
Nasal swab
测序技术:
Illumina
组装方法:
BWA Version 7.13
覆盖度:
70x
相关链接:
提交者:
Mohamed Seadawy, AbedElrahman Zekri, Mohamed Shamel, Ahmed Gad, Abdullah Salama, Mostfa Elhoseiny
提交者单位:
Main Chemical Laboratories Egypt Army
提交者地址:
Egypt, Cairo,Almaza
样本信息
编号: OESV1856402 采样时间: 2021-04-24
采样地点:
Africa / Egypt / Cairo
地点补充信息:
-
宿主编号:
-
宿主性别:
-
宿主年龄:
59
采样单位:
Main Chemical Laboratories Egypt Army
采样地址:
Egypt, Cairo,Almaza