毒株信息
编号： OEAV188589 发布时间： 2020-06-15 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/CA-QDX-138/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/CA-QDX-138/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29782
有效碱基数量：
29782
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Illumina MiSeq
组装方法：
bwa v. 0.7.17-r1188; iVar 1.2.2
覆盖度：
>50x
相关链接：
EPI_ISL_467813
提交者：
Anderson,B.P., Rosenthal,S.H., Gerasimova,A., Kagan,R.M. and Owen, R.
提交者单位：
Quest Diagnostics
提交者地址：
33608 Ortega Hwy, San Juan Capistrano, CA 92675, USA
样本信息
编号： OESV188589 采样时间： 2020-03-16
采样地点：
North America / USA / California
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
30
采样单位：
Quest Diagnostics
采样地址：
33608 Ortega Hwy, San Juan Capistrano, CA 92675, USA