系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV21245562
发布时间:
2023-05-05
基因组完整性:
-
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/dog/Colombia/SAN-CIMBIUR-CS76/2021
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/dog/Colombia/SAN-CIMBIUR-CS76/2021
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29573
有效碱基数量:
27874
有效碱基百分比:
94.25%
宿主:
Canis lupus familiaris
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
EPI_ISL_17620241
提交者:
Claudia Magaly Sandoval- Ramírez, Nathalia Ballesteros, Juan Carlos Pinilla, Carolina Hernández, Marina Muñoz, Juan David Ramírez
提交者单位:
Centro de Investigaciones en Microbiología y Biotecnología-UR (CIMBIUR), Facultad de Ciencias Naturales, Universidad del Rosario, Bogotá, Colombia
样本信息
编号:
OESV21245562
采样时间:
2021-09-09
采样地点:
South America / Colombia / Santander / Bucaramanga
地点补充信息:
-
宿主编号:
-
宿主性别:
-
宿主年龄:
1
采样单位:
Universidad de Pamplona
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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virus id
virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020