系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV21659089
发布时间:
2023-09-06
基因组完整性:
-
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/Brazil/MG-LBI-SARS-3802/2023
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/Brazil/MG-LBI-SARS-3802/2023
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29766
有效碱基数量:
28974
有效碱基百分比:
97.34%
宿主:
Human
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
EPI_ISL_18228411
提交者:
Paula Fonseca, João Locke Ferreira. Clarisse, Danielle Zauli, Renan Pedra, Renato Aguiar
提交者单位:
Laboratório de Biologia Integrativa
样本信息
编号:
OESV21659089
采样时间:
2023-07-05
采样地点:
South America / Brazil / Minas Gerais / Belo Horizonte
地点补充信息:
-
采样单位:
Hermes Pardini Institute
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
virus id
virus name
host
country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020