毒株信息
编号： OEAV238387 发布时间： 2020-08-12 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/SaudiArabia/KAUST-JEDDAH756/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/SaudiArabia/KAUST-JEDDAH756/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29903
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Illumina Novaseq
组装方法：
Amplicon gatk bcftools consensus
覆盖度：
70147.9
相关链接：
EPI_ISL_512999
提交者：
Amit Kumar Subudhi, Rahul P Salunke, Sara Mfarrej, Sharif Hala, Fadwa Alofi, Fathia Ben Rached, Afrah Alsomali, Asim Khogeer, Nashwa Al-khotani, Raeece Naeem, Anwar Hashem, Naif Almontashiri, Arnab Pain
提交者单位：
Pathogen Genomics Lab King Abdullah University of Science and Technology(KAUST)
提交者地址：
4700 King Abdullah University of Science and Technology(KAUST),Thuwal, 23955-6900, Saudi Arabia
样本信息
编号： OESV238387 采样时间： 2020-04-03
采样地点：
Asia / Saudi Arabia / Jeddah
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
27
采样单位：
Pathogen Genomics Lab King Abdullah University of Science and Technology(KAUST)
采样地址：
4700 King Abdullah University of Science and Technology(KAUST),Thuwal, 23955-6900, Saudi Arabia