毒株信息
编号： OEAV3572999 发布时间： 2021-09-14 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/IA-SHL-1837188/2021
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/IA-SHL-1837188/2021
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29769
有效碱基数量：
29495
有效碱基百分比：
99.08%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Nasopharyngeal Swab
测序技术：
Clear Labs Clear Dx
组装方法：
-
覆盖度：
2,680x
相关链接：
EPI_ISL_4169816
提交者：
Valerie Reeb, Erik Twait, Anna Yakos, Mariah Knutson, Kris Eveland, Kristen Zanon, Jeff Benfer, Davis Rieckenberg, Cindy Toll, Wes Hottel, Alankar Kampoowale, Krishnaveni Sompallae, Mohammed Allam
提交者单位：
State Hygienic Laboratory at the University of Iowa
提交者地址：
2490 Crosspark Rd, Coralville, IA
样本信息
编号： OESV3572999 采样时间： 2021-09-07
采样地点：
North America / USA / Iowa
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
24
采样单位：
State Hygienic Laboratory at the University of Iowa
采样地址：
2490 Crosspark Rd, Coralville, IA