毒株信息
编号： OEAV3786808 发布时间： 2021-08-25 基因组完整性： partial
病毒类型
RNA viruses
毒株名称：
SARS-CoV-2/environment/USA/Boston_E_G_027/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), and ORF6 protein (ORF6) genes, complete cds; ORF7a protein (ORF7a) and ORF7b (ORF7b) genes, partial cds; and ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes
毒株别名：
-
病毒说明：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/environment/USA/Boston_E_G_027/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), and ORF6 protein (ORF6) genes, complete cds; ORF7a protein (ORF7a) and ORF7b (ORF7b) genes, partial cds; and ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度：
29873
有效碱基数量：
28724
有效碱基百分比：
96.15%
宿主：
filter
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Illumina
组装方法：
NGEN v. 17
覆盖度：
-
相关链接：
MW047086
提交者：
Garshick,E.
提交者单位：
Environmental Science & Engineering, Harvard University
提交者地址：
29 Oxford Street, Cambridge, MA 02138, USA
样本信息
编号： OESV3786808 采样时间： 2020-05-20
病毒注释