毒株信息
编号： OEAV400690 发布时间： 2020-12-08 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/PA-MGEL-00328/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/PA-MGEL-00328/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29903
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Nasopharyngeal swab
测序技术：
Illumina Nextseq
组装方法：
breseq v0.34; gdtools
覆盖度：
501
相关链接：
EPI_ISL_682002
提交者：
Mustapha M. Mustapha, Jane W. Marsh, Dan Snyder, Marissa P. Griffith, Stephanie L. Mitchell, Vatsala R. Srinivasa, Kady D. Waggle, Chinelo Ezeonwuku, Vaughn S. Cooper, Lee H. Harrison
提交者单位：
Microbial Genomic Epidemiology Laboratory, University of Pittsburgh
提交者地址：
3550 Terrace Street, Pittsburgh, PA 15261
样本信息
编号： OESV400690 采样时间： 2020-03-03
采样地点：
North America / USA / Pennsylvania / Allegheny County
地点补充信息：
-
采样单位：
UPMC Clinical Microbiology Laboratory
采样地址：
3550 Terrace Street, Pittsburgh, PA 15261