毒株信息
编号： OEAV508605 发布时间： 2021-01-11 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Chile/Santiago-ACC2998/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Chile/Santiago-ACC2998/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29724
有效碱基数量：
29724
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Sputum
测序技术：
Illumina MiSeq
组装方法：
Minimap2, Pilon
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_801556
提交者：
Leonardo I. Almonacid, Ana S. Gonzalez-Reiche, Matthew M. Hernandez, Jorge Levican, Tamara García-Salum, Zenab Khan, Adriana van De Guchte, Ajay Obla, Jayeeta Dutta, Bremy Alburquerque, Eileen Serrano, Erick Salinas, Manuel Ampuero, Hala Alshammary, Juan Soto, Shwetha Hara Sridhar, Ying-Chih Wang, Melissa Smith, Robert Sebra, Fernando Valiente, Aldo Gaggero, Adolfo Garcia-Sastre, Edward C. Holmes, Viviana Simon, Harm van Bakel, Rafael A. Medina.
提交者单位：
MSHS Pathogen Surveillance Program
提交者地址：
1470 Madison Av., New York, NY 10029, USA
样本信息
编号： OESV508605 采样时间： 2020-04-28
采样地点：
South America / Chile / Region Metropolitana de Santiago / Santiago
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
28
采样单位：
Laboratory of Molecular Virology, Pontificia Universidad Católica de Chile
采样地址：
Center for Medical Investigations, Marcoleta 391, Santiago, RM 8330024, Chile