毒株信息
编号： OEAV585124 发布时间： 2020-12-28 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/France/HDF-rega-0417684/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/France/HDF-rega-0417684/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29782
有效碱基数量：
29782
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oropharyngeal swab
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
Artic network assembly method
覆盖度：
660x (average)
相关链接：
EPI_ISL_738242
提交者：
Tony Wawina-Bokalanga, Joan Marti-Carerras, Bert Vanmechelen, Piet Maes
提交者单位：
KU Leuven, Rega Institute, Clinical and Epidemiological Virology
提交者地址：
Rega institute, Herestraat 49 box 1040, BE3000 Leuven, Belgium
样本信息
编号： OESV585124 采样时间： 2020-04-17
采样地点：
Europe / France / Hauts-de-France / Crespin
地点补充信息：
ZIP code:59154
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
35
采样单位：
UZ Leuven, National Reference Laboratory for Coronaviruses, Laboratory Medicine, Leuven, Belgium
采样地址：
Herestraat 49, BE3000 Leuven, Belgium