系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV607368
发布时间:
2021-02-05
基因组完整性:
-
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/France/HDF-IPL/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/France/HDF-IPL/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29782
有效碱基数量:
29782
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Nanopore MinION
组装方法:
ARTIC 1.0.0
覆盖度:
-
相关链接:
EPI_ISL_940555
提交者:
Belouzard S., Dubuisson J., Beury D., Maurier F., Hot D., Caboche S.
提交者单位:
Transcriptomics & Applied Genomics (TAG)
提交者地址:
Institut Pasteur de Lille 1 Rue du Professeur Calmette 59019 Lille - France
样本信息
编号:
OESV607368
采样时间:
2021-01-06
采样地点:
Europe / France / Hauts-de-France
地点补充信息:
-
采样单位:
Molecular & Cellular Virology Center for Infection and Immunity of Lille (CIIL) Inserm U1019, CNRS UMR 9017, Univ. Lille
采样地址:
Institut Pasteur de Lille 1 Rue du Professeur Calmette 59019 Lille - France
NC_045512.2:28144:
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以下
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virus id
virus name
host
country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020