CircID: TC-hsa-COL1A2_0096
CircRNA information
Taxonomy:
Genome Version:
hg38
Location:
chr7:94414241~94420436
Evidences
| Ribosome/polysome profiling | 0.0 |
Evidence score: 2.816387
MS Q-Value: 0.009436
|
| ORF | 1.0 | |
| IRES sequence | 0.02004 | |
| Translation initiation site | 0.0 | |
| SeqComp | 0.79635 | |
| m6A sites | 0.0 | |
| MS evidence | 1.0 |
Other evidences Upload
| File | Author | Date |
|---|
Structure
IRES
m6A
TIS
circRNA sequence
GTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGGTCTCCATGGTGAGTTTGGTCTCCCTGGTCCTGCTGGTCCAAGAGGGGAACGCGGTCCCCCAGGTGAGAGTGGTGCTGCCGGTCCTACTGGTCCTATTGGAAGCCGAGGTCCTTCTGGACCCCCAGGGCCTGATGGAAACAAGGGTGAACCTGGTGTGGTTGGTGCTGTGGGCACTGCTGGTCCATCTGGTCCTAGTGGACTCCCAGGAGAGAGGGGTGCTGCTGGCATACCTGGAGGCAAGGGAGAAAAGGGTGAACCTGGTCTCAGAGGTGAAATTGGTAACCCTGGCAGAGATGGTGCTCGTGGTGCTCCTGGTGCTGTAGGTGCCCCTGGTCCTGCTGGAGCCACAGGTGACCGGGGCGAAGCTGGGGCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTCGGGGAAGCCCTGGTGAACGTGGTGAGGTCGGTCCTGCTGGCCCCAATGGATTTGCTG
Exons
- exon1:94414241~94414275
- exon2:94415226~94415270
- exon3:94416405~94416503
- exon4:94417724~94417831
- exon5:94418499~94418552
- exon6:94419498~94419551
- exon7:94420233~94420286
- exon8:94420391~94420436
IRES sequence
- 94416497~94416502
circRNA specific ORFs
Attribute
ORF struct
circRNA sequence
Amino acid sequence
MS evidence
- Start: 192
- Stop: 191
- Length: 1485
- Translation cycles: 3
GTGGTTGGTGCTGTGGGCACTGCTGGTCCATCTGGTCCTAGTGGACTCCCAGGAGAGAGGGGTGCTGCTGGCATACCTGGAGGCAAGGGAGAAAAGGGTGAACCTGGTCTCAGAGGTGAAATTGGTAACCCTGGCAGAGATGGTGCTCGTGGTGCTCCTGGTGCTGTAGGTGCCCCTGGTCCTGCTGGAGCCACAGGTGACCGGGGCGAAGCTGGGGCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTCGGGGAAGCCCTGGTGAACGTGGTGAGGTCGGTCCTGCTGGCCCCAATGGATTTGCTGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGGTCTCCATGGTGAGTTTGGTCTCCCTGGTCCTGCTGGTCCAAGAGGGGAACGCGGTCCCCCAGGTGAGAGTGGTGCTGCCGGTCCTACTGGTCCTATTGGAAGCCGAGGTCCTTCTGGACCCCCAGGGCCTGATGGAAACAAGGGTGAACCTGGTGTGGTTGGTGCTGTGGGCACTGCTGGTCCATCTGGTCCTAGTGGACTCCCAGGAGAGAGGGGTGCTGCTGGCATACCTGGAGGCAAGGGAGAAAAGGGTGAACCTGGTCTCAGAGGTGAAATTGGTAACCCTGGCAGAGATGGTGCTCGTGGTGCTCCTGGTGCTGTAGGTGCCCCTGGTCCTGCTGGAGCCACAGGTGACCGGGGCGAAGCTGGGGCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTCGGGGAAGCCCTGGTGAACGTGGTGAGGTCGGTCCTGCTGGCCCCAATGGATTTGCTGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGGTCTCCATGGTGAGTTTGGTCTCCCTGGTCCTGCTGGTCCAAGAGGGGAACGCGGTCCCCCAGGTGAGAGTGGTGCTGCCGGTCCTACTGGTCCTATTGGAAGCCGAGGTCCTTCTGGACCCCCAGGGCCTGATGGAAACAAGGGTGAACCTGGTGTGGTTGGTGCTGTGGGCACTGCTGGTCCATCTGGTCCTAGTGGACTCCCAGGAGAGAGGGGTGCTGCTGGCATACCTGGAGGCAAGGGAGAAAAGGGTGAACCTGGTCTCAGAGGTGAAATTGGTAACCCTGGCAGAGATGGTGCTCGTGGTGCTCCTGGTGCTGTAGGTGCCCCTGGTCCTGCTGGAGCCACAGGTGACCGGGGCGAAGCTGGGGCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTGCTGGTCCTCGGGGAAGCCCTGGTGAACGTGGTGAGGTCGGTCCTGCTGGCCCCAATGGATTTGCTGGTCCCGCTGGTGAAGTTGGCAAACCAGGAGAAAGGGGTCTCCATGGTGAGTTTGGTCTCCCTGGTCCTGCTGGTCCAAGAGGGGAACGCGGTCCCCCAGGTGAGAGTGGTGCTGCCGGTCCTACTGGTCCTATTGGAAGCCGAGGTCCTTCTGGACCCCCAGGGCCTGATGGAAACAAGGGTGAACCTGGT
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