在脱氧胆酸柠檬酸琼脂上，菌落最初无色，但几天后展现出由乳糖发酵细胞构成的鲜艳粉红色乳头状突起。在MacConkey琼脂上，第一相菌落与其他志贺菌的菌落难以区分，而第二相菌落则更大、更平坦、更透明，并具有不规则边缘。在继代培养中，第一相菌落会产生第一相和第二相菌落，而第二相菌落仅产生第二相菌落。某些菌株可能发酵D-木糖。产过氧化氢酶，但不产吲哚。鸟氨酸脱羧，精氨酸可能脱羧。它们是人类和亚人类灵长类动物的肠道病原体，引起细菌性痢疾。人类是主要的宿主库。少数病例中会出现长期带菌状态。所致疾病通常比其他志贺菌亚群引起的疾病更为轻微。虽然致病性（即引起痢疾的能力）作为肠杆菌科分类的标准（Carpenter, 1963）并未得到国际细菌命名委员会肠杆菌科小组委员会的认可，但它影响并且持续影响志贺菌的分类，因为只有能够引起痢疾的菌株才会被考虑是志贺氏菌。多年来，那些有说服力的研究结果可能会促使我们放弃这一分类，因为这些研究揭示了志贺菌与大肠杆菌之间足够紧密的关系，以至于可以认为它们属于同一物种。Pupo等人(2000年)所采用的名称Escherichia coli clone Dysenteriae, Escherichia coli clone Flexneri, Escherichia coli clone Boydii, and Escherichia coli clone Sonnei，反映了志贺菌与大肠杆菌之间已有充分文献记载的自然关系，从进化论的角度来看是有价值的。S. boydii 这个物种和其他志贺氏菌关系较远，其分类地位具有疑问。